回复一下,porechop已经安装好啦!十分感谢大佬的回答,后续使用bioconda直接安装的,也可以正常使用,之前可能是有些别的什么原因导致不能安装吧。
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fpengstudy
@fpengstudy
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@k1995 你好我试过了,我大概按照的以下这个方法进行的操作。但是按照这个流程操作后,我重启了conda环境也还是没有改变gcc的版本号
conda install -c moussi gcc_impl_linux-64
ln -s /share2/home/anconda3/envs/my_env/libexec/gcc/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/7.3.0/gcc /share2/home/anaconda3/my_env/bin/gcc
conda install gcc_linux-64
conda deactivate
conda activate my_en
gcc -v
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最近在学习三代测序分析流程,查询到porechop是一款专门针对Nanopore去除接头的软件,查询到porechop需要g++4.9.1以上版本。但由于服务器没有root权限,使用了很多方法(包括conda)无法更新,想请问有什么方法可以让g++在自己设立的conda base 环境中升级
Porechop的无权限安装流程
Porechop的无权限安装流程
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